Nos axes de recherche

ARN, Épigénétique & Stress

Epigénétique et ARN : Assemblage de l'hétérochromatine et réduction au silence de l’expression génique par l'ARN

En utilisant la levure à fission Schizosaccharomyces pombe (S. pombe) et des lignées cellulaires humaines comme systèmes modèles éloignés sur le plan évolutif, nous étudions le rôle et la régulation des ARN non codants (ARNnc) et de la transcription qui les produit dans le contexte de l'hétérochromatine péricentromérique. Nos études initiales chez S. pombe ont mis en évidence une fonction conservée d’ARNnc dans la formation de l'hétérochromatine et dans la réduction au silence de l’expression génique au sein de l'hétérochromatine. Nos travaux en cours explorent cette fonction chez l’Homme dans les régions péricentromériques. Parallèlement, nos travaux récents ont démontré un autre rôle clé des ARNnc péricentromériques dans la reprogrammation de l'expression du génome humain en réponse au stress thermique.

(Hétéro)Chromatine, ARN et Stress : Contrôle de la réponse au stress cellulaire par des protéines de liaison de l'ARN de la famille YTH

En nous concentrant sur deux membres de la famille conservée des protéines de liaison à l'ARN possédant un domaine YTH et sur la réponse de la cellule à divers stress, nous étudions le rôle des transcrits (ARNnc et ARNm) agissant dans l'environnement de la chromatine et leur méthylation sur l’Adénosine (m6A, qui est reconnue spécifiquement par les protéines YTH) pour contrôler l'expression génique. Nos travaux ont mis en évidence un nouveau processus associé à la chromatine, et à la fois dépendant de la protéine YTH de la levure S. pombe, appelée Mmi1, et d’ARNnc, qui contrôle l'entrée en différenciation sexuelle, induite par un stress métabolique (i.e, la privation de nutriments). Nos travaux en cours visent à déterminer la potentielle conservation de ce processus dans les cellules humaines en explorant où, quand et comment l'association de la protéine YTHDC1 avec les transcrits naissants contribue à la régulation de l’expression génique en réponse à un stress thermique.

Ingénierie innovante de l’édition des génomes et de la purification de protéines