Équipe
Epigénétique de la Régénération et du Cancer (E-RéCa)

Dpt: Signalisation et Chromatine

Nos activités de recherche

En contrôlant l’expression des gènes, l’organisation de la chromatine définit les identités cellulaires et constitue une barrière à la reprogrammation. Or, suite à des blessures, chaque espèce animale possède un potentiel spécifique pour réaliser de la régénération à grande échelle, impliquant souvent une régression de cellules somatiques à un stade indifférencié, puis leur prolifération et re-différentiation. Puissants pour maintenir l’homéostasie tissulaire, ces mécanismes sont aussi dangereux car ils offrent une fenêtre d’opportunité pour que certaines cellules échappent à leur identité programmée. Notamment, les cellules cancéreuses acquièrent fréquemment la capacité de surmonter et exploiter les barrières chromatiniennes pour contourner leur destin, devenir prolifératives et acquérir des identités aberrantes. La régénération est donc une épée à double tranchant, assurant à la fois l’intégrité des tissus mais étant aussi une voie potentiellement ouverte pour la transformation cancéreuse. Notre objectif est de comprendre les bases épigénétiques de la plasticité cellulaire dans la régénération et le cancer, dans le but d’identifier des mécanismes actionnables pour faciliter la régénération tout en empêchant la tumorigénèse. Notre laboratoire étudie ces mécanismes par des méthodes à haute résolution en épigénomique et en microscopie par l’étude de deux cas modèles: la résistance aux traitements dans les cancers et la régénération des pattes chez le grillon.
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Guillermo ORSI

Chef d’équipe

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Nos axes de recherche

Les cellules cancéreuses modifient leur épigénome pour échapper au contrôle somatique. Avec un focus sur le cancer du sein, nous voulons comprendre comment cette adaptation conditionne leur identité et détermine leur agressivité ainsi que leur réponse aux traitements.

Comme nombre d’autres insectes et arthropodes, les grillons ont la capacité de régénérer entièrement leurs pattes suite à une amputation. Nous voulons comprendre les mécanismes épigénomiques permettant aux cellules de changer d’identité plusieurs fois pour assurer la bonne tenue de ce processus spectaculaire.

Les complexes Polycomb répriment un choix de gènes cibles pour définir l’identité cellulaire chez les eukaryotes. A travers nos différents modèles et collaborations, nous explorons comment ces protéines ciblent l’ADN de façon à la fois sélective et conditionnelle dans différentes espèces.

Nos publications majeures

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Three classes of epigenomic regulators converge to hyperactivate the essential maternal gene deadhead within a heterochromatin mini-domain

Torres-Campana D, Horard B, Denaud S, Benoit G, Loppin B, Orsi GA.

PLoS Genet 2022 Jan 4;18(1):e1009615. doi: 10.1371/journal.pgen.1009615

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The Lid/KDM5 histone demethylase complex activates a critical effector of the oocyte-to-zygote transition

Torres-Campana D#, Kimura S#, Orsi GA, Horard B, Benoit G, Loppin B.

PLoS Genet 2020 Mar 5;16(3):e1008543. doi:10.1371/journal.pgen.1008543

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Two HIRA- dependent pathways mediate H3.3 de novo deposition and recycling during transcription

Torné J, Ray-Gallet D, Boyarchuk E, Garnier M, Le Baccon P, Coulon A, Orsi GA*, Almouzni…

Nat Struct Mol Biol. 2020 Nov;27(11):1057-1068. doi: 10.1038/s41594-020-0492-7

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High-resolution visualization of H3 variants during replication reveals their controlled recycling

Clément C, Orsi GA, Gatto A, Boyarchuk E, Forest A, Hajj B, Miné-Hattab J, Garnier M,…

Nat Commun 2018 Aug 9;9(1):3181. doi:10.1038/s41467-018-05697-1

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Imaging Newly Synthesized and Old Histone Variant Dynamics Dependent on Chaperones Using the SNAP-Tag System

Torné J, Orsi GA, Ray-Gallet D, Almouzni G.

Methods Mol Biol 2018 1832:207-221. doi: 10.1007/978-1-4939-8663-7_11. PMID: 30073529.

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Mapping regulatory factors by immunoprecipitation from native chromatin

Orsi GA#, Kasinathan S#, Zentner GE, Henikoff S, Ahmad K.

Curr Protoc Mol Biol 2015 Apr 1;110:21.31.1-21.31.25. doi: 10.1002/0471142727.mb2131s110.

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High-resolution mapping defines the cooperative architecture of Polycombresponse elements

Orsi GA, Kasinathan S, Hughes KT, Saminadin-Peter S, Henikoff S, Ahmad K.

Genome Res 2014 May;24(5):809-20. doi:10.1101/gr.163642.113

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High-resolution mapping of transcription factor binding sites on native chromatin

Kasinathan S, Orsi GA, Zentner GE, Ahmad K, Henikoff S.

Nat Methods 2014 Feb;11(2):203-9. doi: 10.1038/nmeth.2766

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Drosophila Yemanuclein and HIRA cooperate for de novo assembly of H3.3-containing nucleosomes in the male pronucleus

Orsi GA, Algazeery A, Meyer RE, Capri M, Sapey-Triomphe LM, Horard B, Gruffat H, Couble…

PLoS Genet. 2013 9(2):e1003285. doi: 10.1371/journal.pgen.1003285.

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Nucleosome-depleted chromatin gaps recruit assembly factors for the H3.3 histone variant.

Schneiderman JI#, Orsi GA#, Hughes KT, Loppin B, Ahmad K.

Proc Natl Acad Sci U S A 2012 Nov 27;109(48):19721-6. doi: 10.1073/pnas.1206629109

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Nos activités en images

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