Plateforme
GEMELI

Grenoble Métabolomique et Lipidomique en Santé

Présentation

La plateforme GEMELI propose une offre de services et de développements collaboratifs en métabolomique, lipidomique et fluxomique pour la santé et les biotechnologies.
GEMELI est composée de 3 plateaux techniques rassemblant des équipements de pointe pour la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) et la Spectrométrie de Masse (MS) ainsi que les expertises complémentaires des laboratoires IAB et TIMC dans les domaines de la métabolomique & lipidomique par RMN (plateau RMN), de la lipidomique et fluxomique MS (plateau Apicolipid), et de la métabolomique MS (plateau GExiM).
La plateforme propose son expertise dans les axes de R&D suivants :

  • la découverte et validation de biomarqueurs de diagnostic et prédiction pour la recherche clinique translationnelle et la médecine de précision;
  • le phénotypage moléculaire haut débit des populations;
  • l’identification de voies métaboliques cibles par exemple pour le développement de traitements innovants (pour les pathologies infectieuses, maladies métaboliques, etc…);
  • l’étude non ciblée du métabolisme cellulaire, des flux métaboliques et la quantification du métabolisme en temps réel applicables en recherche fondamentale et translationnelle;
  • l’analyse pharmaco-métabo/lipidomique dans les différentes phases de développement du médicament.

Le développement de la plateforme est soutenu par le programme IRICE de la Région Auvergne Rhône Alpes.

La plateforme est labellisée IBISA.

Voir le site web de la plateforme Gemeli_official graphical-abstract-gemeli.jpg

Responsables

Bénédicte ELENA-HERRMANN

DR CNRS, Responsable R&D RMN

Cyrille BOTTÉ

DR1 CNRS, Responsable R&D lipidomique

Joran VILLARET

IR UGA, Responsable Opérationnel RMN

Yoshiki YAMARYO-BOTTÉ

IR UGA, Responsable Scientifique et Technique Lipidomique Plateforme GEMELI


Pôles d'expertises

Notre plateau de RMN offre une combinaison unique d'équipements de pointe et d'expertise dans les développements méthodologiques fondamentaux de RMN pour les applications de métabolomiques à haut débit en santé. Cet axe est dirigé par le Dr Benedicte Elena-Herrmann (IAB).

Le plateau Apicolipid présente une configuration unique pour la lipidomique à haut débit dans un laboratoire de confinement P3* sur notre site de Jean-Roget. Cet axe est dirigé par le Dr Cyrille Botté (IAB).

Le plateau GExIM est une structure technologique hospitalo-universitaire (UGA et CHUGA) centrée sur la métabolomique par MS pour la recherche et le diagnostic cliniques. Cet axe est dirigé par le Dr. Audrey Le Gouellec (TIMC).

Nos publications majeures

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A P5-ATPase, TgFLP12, diverging from plant chloroplast lipid transporters mediates apicoplast fatty export in Toxoplasma.

Arnold CS, Alazzi AM, Shunmugam S, Janouškovec J, Berry L, Charital S, Gautier T, Duley…

Nature Communications 2025 Lipids are crucial for Apicomplexa survival in their human hosts. They can acquire lipids from the host cell and/or make its own in a relict non-photosynthetic and essential plastid, the apicoplast, which represents a plant-like Achilles’ Heel for the par

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Hydrogenous and deuterated phospholipid extracts from Escherichia coli as biomimetic cytoplasmic bacterial membranes.

Corucci G, Sánchez-Puga P, Batchu KC, Paracini N, Micciulla S, Laux V, Carrascosa-Tejedor J, Frewein…

Chemistry and Physics of Lipids 2025

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The antimicrobial activity of ETD151 defensin is dictated by the presence of glycosphingolipids in the targeted organisms.

Kharrat O, Yamaryo-Botté Y, Nasreddine R, Voisin S, Aumer T, Cammue BPA, Madinier JB, Knobloch…

PNAS 2024

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Developing advanced models of biological membranes with hydrogenous and deuterated natural glycerophospholipid mixtures

Corucci G, Batchu KC, Luchini A, Santamaria A, Frewein MPK, Laux V, Haertlein M, Yamaryo-Botté…

J Colloid Interface Sci 2023 Sep;645:870-881. doi: 10.1016/j.jcis.2023.04.135

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Developing advanced models of biological membranes with hydrogenous and deuterated natural glycerophospholipid mixtures.

Corucci G, Batchu KC, Luchini A, Santamaria A, Frewein MPK, Laux V, Haertlein M, Yamaryo-Botté…

Journal of Colloidal and Interface Science 2023

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Nucleoside diphosphate kinases 1 and 2 regulate a protective liver response to a high-fat diet.

Iuso D, Garcia-Saez I, Couté Y, Yamaryo-Botté Y, Boeri Erba E, Adrait A, Zeaiter N,…

Science Advances 2023

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Investigation of circulating metabolites associated with breast cancer risk by untargeted metabolomics: a case-control study nested within the French E3N cohort

Jobard E, Dossus L, Baglietto L, Fornili M, Lécuyer L, Mancini FR, Gunter MJ, Trédan…

Br J Cancer 2021 May;124(10):1734-1743. doi: 10.1038/s41416-021-01304-1

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Toxoplasma LIPIN is essential in channeling host lipid fluxes through membrane biogenesis and lipid storage.

Dass S, Shunmugam S, Berry L, Arnold CS, Katris NJ, Duley S, Pierrel F, Cesbron-Delauw…

Nature Communications 2021 Apicomplexan parasites require large amount of lipids that can be acquired from both host scavenging and de novo synthesis via the parasites’ own metabolic pathways. Both host and de novo synthesized lipids are essential for parasite membrane biogenesis a

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Division and Adaptation to Host Environment of Apicomplexan Parasites Depend on Apicoplast Lipid Metabolic Plasticity and Host Organelle Remodeling.

Amiar S, Katris NJ, Berry L, Dass S, Duley S, Arnold CS, Shears MJ, Brunet…

Cell Reports 2020 CNRS National Press release: https://www.insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/comment-le-parasite-sadapte-la-nutrition-de-son-hote

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Fast and ergonomic extraction of adherent mammalian cells for NMR-based metabolomics studies

Mili M.; Panthu B, Madec A.-M, Berger M.-A, Rautureau G. J. P, Elena-Herrmann B

Anal. Bioanal. Chem. 2020 412, 5453. doi: 10.1007/s00216-020-02764-9.

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Nos activités en images

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