Plateforme
GEMELI

Grenoble Métabolomique et Lipidomique en Santé

Présentation

La plateforme GEMELI propose une offre de services et de développements collaboratifs en métabolomique, lipidomique et fluxomique pour la santé et les biotechnologies.
GEMELI est composée de 3 plateaux techniques rassemblant des équipements de pointe pour la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) et la Spectrométrie de Masse (MS) ainsi que les expertises complémentaires des laboratoires IAB et TIMC dans les domaines de la métabolomique & lipidomique par RMN (plateau RMN), de la lipidomique et fluxomique MS (plateau Apicolipid), et de la métabolomique MS (plateau GExiM).
La plateforme propose son expertise dans les axes de R&D suivants :

  • la découverte et validation de biomarqueurs de diagnostic et prédiction pour la recherche clinique translationnelle et la médecine de précision;
  • le phénotypage moléculaire haut débit des populations;
  • l’identification de voies métaboliques cibles par exemple pour le développement de traitements innovants (pour les pathologies infectieuses, maladies métaboliques, etc…);
  • l’étude non ciblée du métabolisme cellulaire, des flux métaboliques et la quantification du métabolisme en temps réel applicables en recherche fondamentale et translationnelle;
  • l’analyse pharmaco-métabo/lipidomique dans les différentes phases de développement du médicament.

Le développement de la plateforme est soutenu par le programme IRICE de la Région Auvergne Rhône Alpes.

La plateforme est labellisée IBISA.

Voir le site web de la plateforme Gemeli_official graphical-abstract-gemeli.jpg

Responsables

Bénédicte ELENA-HERRMANN

DR CNRS, Responsable R&D RMN

Cyrille BOTTÉ

DR CNRS, Responsable R&D lipidomique

Joran VILLARET

IR UGA, Responsable Opérationnel RMN

Yoshiki YAMARYO-BOTTÉ

IR UGA, Responsable Opérationnel MS


Pôles d'expertises

Notre plateau de RMN offre une combinaison unique d'équipements de pointe et d'expertise dans les développements méthodologiques fondamentaux de RMN pour les applications de métabolomiques à haut débit en santé. Cet axe est dirigé par le Dr Benedicte Elena-Herrmann (IAB).

Le plateau Apicolipid présente une configuration unique pour la lipidomique à haut débit dans un laboratoire de confinement P3* sur notre site de Jean-Roget. Cet axe est dirigé par le Dr Cyrille Botté (IAB).

Le plateau GExIM est une structure technologique hospitalo-universitaire (UGA et CHUGA) centrée sur la métabolomique par MS pour la recherche et le diagnostic cliniques. Cet axe est dirigé par le Dr. Audrey Le Gouellec (TIMC).

Nos publications majeures

Voir toutes les publications

Developing advanced models of biological membranes with hydrogenous and deuterated natural glycerophospholipid mixtures

Corucci G, Batchu KC, Luchini A, Santamaria A, Frewein MPK, Laux V, Haertlein M, Yamaryo-Botté…

J Colloid Interface Sci 2023 Sep;645:870-881. doi: 10.1016/j.jcis.2023.04.135

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Investigation of circulating metabolites associated with breast cancer risk by untargeted metabolomics: a case-control study nested within the French E3N cohort

Jobard E, Dossus L, Baglietto L, Fornili M, Lécuyer L, Mancini FR, Gunter MJ, Trédan…

Br J Cancer 2021 May;124(10):1734-1743. doi: 10.1038/s41416-021-01304-1

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Ion identity molecular networking for mass spectrometry-based metabolomics in the GNPS environment

Schmid R, Petras D, Nothias LF, Wang M, Aron AT, Jagels A, Tsugawa H, Rainer…

Nat Commun 2021 Jun 22;12(1):3832. doi: 10.1038/s41467-021-23953-9

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Toxoplasma LIPIN channels host lipid fluxes sustaining parasite survival through the balance between membrane biogenesis and lipid storage

Dass S*, Shunmugam S*, Berry L, Arnold CS, Duley S., Pierrel F., Katris N, Cesbron…

Nat. Commun 2021 12:2813. doi: 10.1038/s41467-021-22956-w.

Untargeted metabolomics approach to discriminate mistletoe commercial products

Vanhaverbeke C, Touboul D, Elie N, Prévost M, Meunier C, Michelland S, Cunin V, Ma…

Sci Rep 2021 11, 14205. doi: 10.1038/s41598-021-93255-z.

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Division and adaptation to host nutritional environment of apicomplexan parasites depend on apicoplast lipid metabolic plasticity and host organelles remodeling

Amiar S, Katris NJ, Berry L, Dass S, Shears MJ, Brunet C, Touquet B, McFadden…

Cell Rep. 2020 30(11):3778-3792.e9. doi: 10.1016/j.celrep.2020.02.072

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Fast and ergonomic extraction of adherent mammalian cells for NMR-based metabolomics studies

Mili M.; Panthu B, Madec A.-M, Berger M.-A, Rautureau G. J. P, Elena-Herrmann B

Anal. Bioanal. Chem. 2020 412, 5453. doi: 10.1007/s00216-020-02764-9.

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Multi-platform NMR Study of Pluripotent Stem Cells Unveils Complementary Metabolic Signatures towards Differentiation

Elena-Herrmann B, Montellier E, Fages A, Bruck-Haimson R, Moussaieff A

Sci. Rep 2020 10, 1622. doi: 10.1038/s41598-020-58377-w

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Prebiotic role of softwood hemicellulose in healthy mice model

Deloule V, Boisset C, Hannani D, Suau A, Le Gouellec A, Chroboczek J, Botté C,…

J. Funct. Foods 2020 64, 103688. doi:10.1016/j.jff.2019.103688

Discrimination of Escherichia coli and Shigella spp. by Nuclear Magnetic Resonance Based Metabolomic Characterization of Culture Media

Rautureau G. J. P, Palama T. L, Canard I, Mirande C, Chatellier S, Van Belkum…

ACS Infect. Dis 2019 5, 1879. doi: 10.1021/acsinfecdis.9b00199

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Nos activités en images

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