Équipe
Biologie Structurale de Nouvelles Cibles dans les Maladies Humaines

Dpt: Signalisation et Chromatine

Nos activités de recherche

Notre groupe de recherche utilise une approche intégrée de biologie structurale et de biophysique combinée à des études fonctionnelles pour comprendre les mécanismes d'inhibition de nouvelles cibles protéiques et ARN impliquées dans des maladies humaines, et utilise ces informations en vue de développer de nouvelles thérapies. En collaboration avec des équipes académiques et industrielles, nous améliorons la puissance et la sélectivité des inhibiteurs avec applications biomédicales.
Voir le site web de l'équipe PalenciaLab 093921-21072023-abstract-palencia.png

Andrés PALENCIA

PhD, HDR et Chef d’équipe

04 76 54 95 75

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Nos axes de recherche

Nous utilisons une approche intégrative de biologie structurale pour comprendre les systèmes biologiques en combinant les snapshots structuraux obtenus par la cristallographie aux rayons X et la microscopie cryo-électronique avec les informations sur la dynamique obtenus par la spectroscopie RMN en solution.

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Ces protéines sont responsables de la fixation de l'acide aminé correct à l'ARNt correspondant (aminoacylation) et de la prévention d'une fixation erronée des acides aminés non corrects sur l'ARNt (édition). Les AARS sont des cibles thérapeutiques intéressantes car elles sont essentielles à la traduction des protéines et présentent des différences entre les microbes et les humains que nous exploitons pour la découverte de médicaments.

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Chez les eucaryotes, la maturation de pré-ARNm se fait par l'action concertée de complexes qui clivent l'extrémité 3' des pre-ARNm avant l'ajout (ou non) de la queue poly-A et l'exportation vers le cytoplasme pour la traduction. Comme ces processus sont dérégulés dans les maladies humaines, nous étudions le ciblage de protéines clés pour des applications thérapeutiques, notamment dans le cancer, mais aussi dans les maladies infectieuses.

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La transcription par l'ARN polymérase III produit des précurseurs ARNt contenant des séquences 3' (trailer) et 5' (leader) qui doivent être clivées. Nous étudions les mécanismes moléculaires menant à la maturation des ARNt 3' eucaryotes, un processus qui est dérégulé dans plusieurs maladies humaines.

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Nos publications majeures

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Targeting a microbiota Wolbachian aminoacyl-tRNA synthetase to block its pathogenic host.

Hoffmann, G., Lukarska, M., Clare, RH., Masters, EKG., Johnston, KL., Ford, L., Turner, JD., Ward,…

Science Advances 2024 10(28):eado1453. doi: 10.1126/sciadv.ado1453.

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Adenosine Dependent Activation Mechanism of Prodrugs Targeting an Aminoacyl-tRNA Synthetase

Hoffmann, G., Le Gorrec, M., Mestdach, E., Cusack, S., Salmon, L., *Jensen, MR. & *Palencia,…

Journal of The American Chemical Society 2023 145(2), 800-810. *Corresponding authors

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Human Histone pre-mRNA Assembles Histone- or Canonical-mRNA Processing Complexes by Overlapping 3’-End Sequence Elements

Ielasi, F.S., Ternifi, S., Fontaine, E., Iuso, D., Couté, Y. & *Palencia A.

Nucleic Acids Research 2022 28; 50 (21):12425-12443

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Visualizing protein breathing motions associated with aromatic ring flipping

Mariño Perez, L., Ielasi, FS., Bessa, LM., Maurin, D., Kragelj, J., Salvi, N., Bouvignies, G., *Palencia,…

Nature 2022 602, 695-700. *Corresponding authors

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Metal-captured inhibition of pre-mRNA processing activity by CPSF3 controls Cryptosporidium infection

Swale, C., Bougdour, A., Gnahoui-David, A., Tottey, J., Georgeault, S., *Laurent,  F., *†Palencia, A.  *†Hakimi, M.A.

Science Trans. Medicine 2019 6;11(517). †Equally contributing authors

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Targeting Toxoplasma gondii CPSF3 as a new approach to control toxoplasmosis

*†Palencia, A., †*Bougdour, A., Brenier-Pinchart, MP., Touquet, B., Bertini, RL., Sensi, C. et al. 

EMBO Molecular Medicine 2017 9: 385-394 . Highlighted in  France 3 news. *Corresponding Authors.

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Discovery of novel oral protein synthesis inhibitors of Mycobacterium tuberculosis that target leucyl-tRNA synthetase

Palencia*, A., Li, X., Bu, W., Ding, C., Easom, E., Feng, et al.

Antimicrobial agents and chemotherapy 2016 60(10):6271-80

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Structural characterisation of antibiotic self-immunity tRNA synthetase in plant tumour biocontrol agent.

Chopra, S.†, Palencia, A.†, et al.

Nature comm 2016 7:12928 †Joint-First Authors

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Plant tumour biocontrol agent employs a tRNA-dependent mechanism to inhibit leucyl-tRNA synthetase

†Chopra, S., †Palencia, A., et al. 

Nature comm 2013 4, 1417. †Joint-First Authors.

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Structural dynamics of the aminoacylation and proofreading functional cycle of bacterial leucyl-tRNA synthetase

Palencia, A., Crepin, T., et al.

Nature Struct. & Mol. Biol 2012 19, 677-84.

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Nos activités en images

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Nos collaborations

  • Malene Jensen, IBS, Grenoble, France
  • Rolf Müller, Helmholtz Institute, Saarbrücken, Germany
  • Paul Finn, Oxford Drug Design, Oxford, UK
  • Philip Rosenthal, UCSF, San Francisco, USA
  • Vincent Cattoir, Inserm U1230, CHU Rennes, France
  • Wojtek Galej, EMBL, Grenoble, France

Nos technologies

  • Approche Intégrative en Biologie Structurale
  • Production d'ARNs, et de Protéines dans des Bactéries, des Cellules d'Insectes et des Systèmes de Mammifères
  • Cristallisation de Protéines, d'ARNs et d'Inhibiteurs (Petites Molécules, Peptides ...)
  • Cristallographie aux Rayons X, RMN et (Cryo) Microscopie Electronique
  • Méthodes Biophysiques pour Guider Drug Discovery et l'Optimisation des Hits
  • Approches in silico pour l'identification de nouveaux inhibiteurs